MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A2497

Total Repeats: 20103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016798	AGG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376282009
2	NC_016798	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	376282009
3	NC_016798	GAA	2	6	87	92	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282009
4	NC_016798	GTTC	2	8	109	116	0 %	50 %	25 %	25 %	376282009
5	NC_016798	GTA	2	6	131	136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282009
6	NC_016798	AGT	2	6	162	167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282009
7	NC_016798	GA	3	6	206	211	50 %	0 %	50 %	0 %	376282009
8	NC_016798	GCGT	2	8	294	301	0 %	25 %	50 %	25 %	376282009
9	NC_016798	AAG	2	6	318	323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282009
10	NC_016798	CAA	2	6	332	337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376282009
11	NC_016798	AGT	2	6	358	363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282009
12	NC_016798	GTG	2	6	374	379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376282009
13	NC_016798	CAG	2	6	410	415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282009
14	NC_016798	AGTG	2	8	541	548	25 %	25 %	50 %	0 %	376282009
15	NC_016798	TGGC	2	8	575	582	0 %	25 %	50 %	25 %	376282009
16	NC_016798	GCC	2	6	598	603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	376282009
17	NC_016798	TGC	2	6	657	662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282009
18	NC_016798	ATT	2	6	669	674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282009
19	NC_016798	CGA	2	6	691	696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282009
20	NC_016798	TC	3	6	819	824	0 %	50 %	0 %	50 %	376282009
21	NC_016798	TAT	2	6	833	838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282009
22	NC_016798	AG	3	6	841	846	50 %	0 %	50 %	0 %	376282009
23	NC_016798	GAA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282009
24	NC_016798	AGA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282009
25	NC_016798	AGA	2	6	963	968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282009
26	NC_016798	CAA	2	6	1036	1041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376282009
27	NC_016798	AATG	2	8	1060	1067	50 %	25 %	25 %	0 %	376282009
28	NC_016798	TTG	2	6	1179	1184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376282009
29	NC_016798	CTC	2	6	1208	1213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376282009
30	NC_016798	GAT	2	6	1270	1275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282009
31	NC_016798	GAT	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282009
32	NC_016798	GAAGGA	2	12	1354	1365	50 %	0 %	50 %	0 %	376282009
33	NC_016798	ATG	2	6	1387	1392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282009
34	NC_016798	CTAT	2	8	1394	1401	25 %	50 %	0 %	25 %	376282009
35	NC_016798	CCT	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376282009
36	NC_016798	CTT	2	6	1607	1612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282009
37	NC_016798	CAG	2	6	1672	1677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282009
38	NC_016798	TGA	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282009
39	NC_016798	ATG	2	6	1930	1935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282010
40	NC_016798	GTG	2	6	1936	1941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376282010
41	NC_016798	TCC	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376282010
42	NC_016798	AGC	2	6	1959	1964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282010
43	NC_016798	T	6	6	1978	1983	0 %	100 %	0 %	0 %	376282010
44	NC_016798	AGC	2	6	1986	1991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282010
45	NC_016798	AAG	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282010
46	NC_016798	TAC	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282010
47	NC_016798	GCT	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282010
48	NC_016798	AGTA	2	8	2083	2090	50 %	25 %	25 %	0 %	376282010
49	NC_016798	AAC	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376282010
50	NC_016798	AGA	2	6	2155	2160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282010
51	NC_016798	AGA	2	6	2411	2416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282011
52	NC_016798	ATC	2	6	2418	2423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282011
53	NC_016798	TGC	2	6	2438	2443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282011
54	NC_016798	ATGA	2	8	2487	2494	50 %	25 %	25 %	0 %	376282011
55	NC_016798	GATA	2	8	2525	2532	50 %	25 %	25 %	0 %	376282011
56	NC_016798	CAT	2	6	2562	2567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282011
57	NC_016798	AGA	2	6	2591	2596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282011
58	NC_016798	AAG	2	6	2620	2625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282011
59	NC_016798	GGA	2	6	2655	2660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376282011
60	NC_016798	AG	3	6	2747	2752	50 %	0 %	50 %	0 %	376282012
61	NC_016798	ATC	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282012
62	NC_016798	TTTC	2	8	2822	2829	0 %	75 %	0 %	25 %	376282012
63	NC_016798	ATA	2	6	2934	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376282012
64	NC_016798	AAC	2	6	2959	2964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	376282012
65	NC_016798	GGT	2	6	3013	3018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376282012
66	NC_016798	AAT	2	6	3119	3124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376282012
67	NC_016798	TTC	2	6	3154	3159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282012
68	NC_016798	GCA	2	6	3173	3178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282012
69	NC_016798	GGA	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376282012
70	NC_016798	CAG	2	6	3240	3245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282012
71	NC_016798	GTT	2	6	3257	3262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376282012
72	NC_016798	GGT	2	6	3349	3354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376282012
73	NC_016798	GA	3	6	3415	3420	50 %	0 %	50 %	0 %	376282012
74	NC_016798	T	6	6	3422	3427	0 %	100 %	0 %	0 %	376282012
75	NC_016798	AAG	2	6	3507	3512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282012
76	NC_016798	ATT	2	6	3569	3574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282012
77	NC_016798	TTG	2	6	3621	3626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376282012
78	NC_016798	CATG	2	8	3703	3710	25 %	25 %	25 %	25 %	376282012
79	NC_016798	AAG	2	6	3732	3737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282012
80	NC_016798	AAG	2	6	3747	3752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282012
81	NC_016798	CAG	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282012
82	NC_016798	GCT	2	6	3860	3865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282012
83	NC_016798	TGTGA	2	10	3875	3884	20 %	40 %	40 %	0 %	376282012
84	NC_016798	TTCC	2	8	4008	4015	0 %	50 %	0 %	50 %	376282012
85	NC_016798	AAG	2	6	4026	4031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282012
86	NC_016798	CAG	2	6	4076	4081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282012
87	NC_016798	GGA	2	6	4163	4168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376282012
88	NC_016798	AAT	2	6	4173	4178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	376282012
89	NC_016798	TTGAA	2	10	4231	4240	40 %	40 %	20 %	0 %	376282013
90	NC_016798	ATT	2	6	4253	4258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282013
91	NC_016798	TGA	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282013
92	NC_016798	TTTA	2	8	4406	4413	25 %	75 %	0 %	0 %	376282013
93	NC_016798	GTA	2	6	4515	4520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282013
94	NC_016798	GAGAA	2	10	4525	4534	60 %	0 %	40 %	0 %	376282013
95	NC_016798	AGA	2	6	4562	4567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282013
96	NC_016798	ATCC	2	8	4706	4713	25 %	25 %	0 %	50 %	376282013
97	NC_016798	GAA	2	6	4746	4751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282013
98	NC_016798	CGT	2	6	4878	4883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282013
99	NC_016798	A	7	7	4922	4928	100 %	0 %	0 %	0 %	376282013
100	NC_016798	GTT	2	6	4929	4934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376282013
101	NC_016798	GAAAA	2	10	4962	4971	80 %	0 %	20 %	0 %	376282013
102	NC_016798	A	7	7	4968	4974	100 %	0 %	0 %	0 %	376282013
103	NC_016798	TGA	2	6	5066	5071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282013
104	NC_016798	TTACA	2	10	5117	5126	40 %	40 %	0 %	20 %	376282013
105	NC_016798	TTG	2	6	5161	5166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376282013
106	NC_016798	TTC	2	6	5302	5307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282013
107	NC_016798	TCT	2	6	5394	5399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282013
108	NC_016798	AGA	2	6	5414	5419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282013
109	NC_016798	GTT	2	6	5441	5446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	376282013
110	NC_016798	GACG	2	8	5453	5460	25 %	0 %	50 %	25 %	376282013
111	NC_016798	GGT	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376282013
112	NC_016798	AAAGCT	2	12	5535	5546	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	376282013
113	NC_016798	TTGG	2	8	5556	5563	0 %	50 %	50 %	0 %	376282013
114	NC_016798	CTC	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	376282013
115	NC_016798	AGC	2	6	5624	5629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282013
116	NC_016798	ATT	2	6	5743	5748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	376282014
117	NC_016798	TCT	2	6	5761	5766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	376282014
118	NC_016798	GCT	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282014
119	NC_016798	GTCTT	2	10	5813	5822	0 %	60 %	20 %	20 %	376282014
120	NC_016798	GAT	2	6	5842	5847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	376282014
121	NC_016798	TC	3	6	5858	5863	0 %	50 %	0 %	50 %	376282014
122	NC_016798	GA	3	6	5869	5874	50 %	0 %	50 %	0 %	376282014
123	NC_016798	ACG	2	6	5880	5885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	376282014
124	NC_016798	GAA	2	6	5904	5909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282014
125	NC_016798	TGGA	2	8	5917	5924	25 %	25 %	50 %	0 %	376282014
126	NC_016798	AT	3	6	5973	5978	50 %	50 %	0 %	0 %	376282014
127	NC_016798	AGA	3	9	5981	5989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282014
128	NC_016798	GCT	2	6	5990	5995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282014
129	NC_016798	AGA	2	6	5999	6004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282014
130	NC_016798	TGG	2	6	6035	6040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	376282014
131	NC_016798	AGA	3	9	6053	6061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	376282014
132	NC_016798	GGA	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	376282014
133	NC_016798	TG	3	6	6126	6131	0 %	50 %	50 %	0 %	376282014
134	NC_016798	T	6	6	6204	6209	0 %	100 %	0 %	0 %	376282014
135	NC_016798	TCA	2	6	6247	6252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	376282014
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139	NC_016798	CTG	2	6	6350	6355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	376282014
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264	NC_016798	AG	3	6	13514	13519	50 %	0 %	50 %	0 %	376282021
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